• Trụ sở: Quận Cầu Giấy, Tp. Hà Nội
• Văn phòng: Hà Nội, Tp. Hồ Chí Minh

Các ban chuyên môn

• Ban Hỗ trợ chất lượng giáo dục đại học
• Ban Tổ chức và phát triển Hiệp hội
• Ban Nghiên cứu và Phân tích chính sách
• Ban Khoa học – Dịch vụ
• Ban Thông tin – Truyền thông
• Ban Hợp tác quốc tế
• Ban Phong trào sinh viên
• Ban Tài chính

Các tổ chức trực thuộc

• Hội đồng cố vấn;
• Hội đồng khoa học;
• Tạp chí điện tử Giáo dục Việt Nam
• Trung tâm Kiểm định chất lượng giáo dục
• Viện Khoa học và Đổi mới công nghệ
• Viện Khoa học Quản lý giáo dục
• Viện Nghiên cứu và Ứng dụng Công nghệ Giáo dục ATEC
• Viện Nghiên cứu, ứng dụng tâm lý trị liệu và phát triển nguồn nhân lực
• Viện Truyền thông và Phát triển nhân lực
• Viện Xúc tiến phát triển giáo dục (IPED)
• Viện Công nghệ & Nhân lực Quốc tế  (ITM)
• Viện NC, đào tạo và chuyển giao công nghệ KH sức khỏe Tuệ Tĩnh
• Trung tâm Tài chính vi mô và phát triển
• Trung tâm bồi dưỡng và hỗ trợ chất lượng giáo dục (EQTS)
• Trung tâm đào tạo quốc tế ASEAN
• Trung tâm nghiên cứu giáo dục đại học
• Trung tâm Nghiên cứu, đào tạo và chuyển giao công nghệ
• Trung tâm Phát triển công nghệ giáo dục đào tạo
• Trung tâm tư vấn hướng nghiệp và đào tạo

Tổ chức bộ máy

• Đại hội toàn thể
• Ban Chấp hành Hiệp hội
• Ban Thường vụ Hiệp hội
• Ban Kiểm tra Hiệp hội
• Thường trực Hiệp hội
• Văn phòng, Các Ban chuyên môn
• Các Tổ chức thuộc Hiệp hội